与其他应用程序在同一桌面上的全屏JavaFX程序?

Swing绝对是一种选择。这里是一个开始的地方:

public class MyClass {

    public void myAction () {    

      // your logic goes here
      System.out.println("hello");

    }

    public static void main(String[] args) {

        MyClass mc = new MyClass();
        mc.myAction();

    }

}