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有没有可能的方法来pickle/序列化通过rpy2导入的R模块?(蟒蛇)

rpy2 pickle serialization r python

O.rka · 技术社区 · 6 年前

R . 我宁愿简化安装过程,而不是让用户为其创建后端 右 所有的包裹。这可能是完全不可避免的,但我想知道是否有任何可能的方式,以序列化形式提供R对象通过 pickle 或者Python中的任何序列化模块?

泡菜 dill 但是没有运气。

>>> import pickle
>>> from rpy2.robjects.packages import importr
>>> r_package = importr("dynamicTreeCut")
>>> r_package
rpy2.robjects.packages.Package as a <module 'dynamicTreeCut'>
>>> with open("./dynamicTreeCut.rpy2.pkl", "wb") as f:
...     pickle.dump(r_package, f)
...
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 2, in <module>
TypeError: can't pickle InstalledSTPackage objects

1 回复 | 直到 6 年前

lgautier 6 年前

您需要R来使用rpy2,如果您希望使用R包,它们必须与R一起安装。如何打包R和包是一个相对独立于rpy2的问题,详细说明这些选项可能超出了SO答案的范围:docker image(请参阅rpy2自己的图片) with Jupyterlab 或 jupyterlab and spark ),用于预编译二进制文件、.deb或.rpm包等的专用安装程序。。。

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