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如何使用jenetics绘制遗传算法中不同世代的适应度

jenetics genetic-algorithm java

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Allan · 技术社区 · 7 年前

一般来说,您将如何打印或绘制使用jenetics库创建的每一代人的健康分数?

我自己的代码更具体:

private static double clashes(final Genotype<EnumGene<Integer>> gt) {
        // Calculate the path distance.



                final int[] intTriplets=gt.getChromosome().stream().mapToInt(EnumGene<Integer>::getAllele).toArray();
                ArrayList<Triplet> triplets=new ArrayList<Triplet>();
                for(int i=0;i<intTriplets.length;i++)
                {
                    Triplet e=intToTriplet.get(intTriplets[i]);
                    triplets.add(e);
                }
                double clashes=returnScore(triplets);

        return (clashes);



public static void main(String[] args) {
        final Engine<EnumGene<Integer>, Double> engine = Engine
            .builder(
                GA::clashes,
                PermutationChromosome.ofInteger(REQUIREMENTS))
            .optimize(Optimize.MINIMUM)
                        .offspringFraction(0.75)//0.6 standaard
                        .survivorsSelector (new TournamentSelector <>(7) )  //standaard new TournamentSelector <>(3)
                        .offspringSelector (new RouletteWheelSelector <>() )  //standaard new TournamentSelector <>(3)
            .maximalPhenotypeAge(40)//standaard 70
            .populationSize(1000)

                       //.selector(new TournamentSelector<>(5))
            .alterers(
                new SwapMutator<>(0.02),
                new PartiallyMatchedCrossover<>(0.7))
            .build();

我注意到可能存在过早收敛,因为尽管将稳态适应度限制设置为200,但我只获得有限的世代数。所以我想弄清楚在哪一代人左右,身体素质得分的变化接近0,并打印出每一代人中最佳元素的身体素质得分。

1 回复 | 直到 5 年前

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Franz Wilhelmstötter 7 年前

你可以在进化过程中用 Stream.peek 方法: java EvolutionResult<EnumGene<Integer>, Double> stream = engine.stream() .limit(100) .peek(er -> System.out.println(er.getBestPhenotype())) .collect(EvolutionResult.toBestEvolutionResult()); 这将为每一代打印出最佳表型。