千兆像素图像的自描述文件格式?

从TIFF或BigTIFF开始,定义一个有用的标记子集+XMP元数据似乎是一条可行之路。FITS不好,因为它基本上用于无损数据,并且没有非常合适的元数据机制。

解决办法很可能是 http://ome-xml.org/ 和 http://ome-xml.org/wiki/OmeTiff

看起来DICOM现在支持: ftp://medical.nema.org/MEDICAL/Dicom/Final/sup145_ft.pdf

FITS .

• 1-3维数据
• 大割台
• 广泛应用于天文学,并得到NASA和IAU的认可

我是一名病理学家(也是程序员爱好者),所以虚拟幻灯片和数字病理学是我的一大兴趣。你可能对这本书感兴趣 OpenSlide project . 他们描述了来自大型供应商(Aperio、BioImagene等)的许多专有格式。大多数似乎是由一个金字塔形的缩放(当然是在不同的显微镜下扫描),包含多个平铺tiff或压缩(JPEG或JPEG2000)图像的大型tiff文件组成。

行业标准是 DICOM Sup 145

PNG 可能对你有用。它可以处理大型图像、元数据,PNG格式可以有一些 interlacing ,因此您可以非常轻松地获得n/8 x n/8降采样图像。

我不确定PNG是否可以快速随机访问。它是分块的,但这可能还不够。