我创建了一个多页PDF,其中包含由数百个唯一标识符生成的绘图。基本上,我希望每页添加一个单独的图例面板。
PDF基本上按照详细信息构建
here
和
here
关于如何使用网格为一些图形对象添加单独的图例,有几十个演练。安排,最有希望的是
here
和
here
.
基本上,步骤是:
-
创建数据库
-
使用Lappy创建图形对象列表,并
-
创建pdf—将图形对象列表分块。
我怀疑这个过程在第3步就失败了——将图例添加到Grob列表中。
到
复制
问题所在
color.names <- setNames(c("A", "B", "C", "D", "F"), c("green3", "chocolate1", "darkgoldenrod1", "firebrick1"))
group.colors <- c(A = "#333BFF", B = "#CC6600", C ="#9633FF", D = "#E2FF33", F = "#E3DB71")
SOexample <- data.frame(
studentid = runif(100,min=500000, max=999999),
grade = runif(100, min=20, max=100),
lettergrade = sample(c("A", "B","C","D","F"),size=100,replace=TRUE),
firstname = sample(c("Alan", "Billy","Charles","Donna","Felicia"),size=100,replace=TRUE)
)
生成图例的步骤
df <- SOexample
gl <- ggplot(df, aes(x=" ", y=as.numeric(grade), ymin=50, ymax=100))+ geom_boxplot()+ guides(fill=FALSE) + geom_point(aes(colour=lettergrade)) + labs( x=" ", y=" ") + ggtitle(sprintf("%s", df$firstname), aes(cex=.05)) + scale_colour_manual(name="Number", values=group.colors) + scale_fill_manual(name="", values="red") + theme_grey() + theme(legend.position="none", plot.title = element_text(size = 8, face = "bold"), plot.subtitle=element_blank()) + theme(axis.title.x=element_blank(), axis.text.x=element_blank(), axis.ticks.x=element_blank())
使用cowplot获取图例的函数
install.packages("cowplot")
library(cowplot)
leg <- get_legend(gs + theme(legend.position="right"))
创建所有图形对象的步骤
plist = lapply(split(SOexample, factor(SOexample$studentid)), function(df) { ggplot(df, aes(x=" ", y=as.numeric(grade), ymin=50, ymax=100))+ geom_boxplot()+ guides(fill=FALSE) + geom_point(aes(colour=lettergrade)) + labs( x=" ", y=" ") + ggtitle(sprintf("%s", df$firstname), aes(cex=.05)) + scale_colour_manual(name="Number", values=group.colors) + scale_fill_manual(name="", values="red") + theme_grey() +theme(legend.position="none", plot.title = element_text(size = 8, face = "bold"), plot.subtitle=element_blank()) + theme(axis.title.x=element_blank(),axis.text.x=element_blank(), axis.ticks.x=element_blank())})
制作PDF
pdf("allpeople.pdf", pointsize=8)
for (i in seq(1, length(plist), 11)) {
grid.arrange(grobs=plist[i:(i+11)],
ncol=4, left="Magic Numbers", bottom=" ")
}
dev.off()
我怀疑这个过程在创建PDF阶段正在崩溃。理想情况下,我会将图例作为图形对象添加到网格中/网格处。安排步骤,例如。,
grobs[12]<- leg
但运气不好,也是
plist()
进程似乎尚未完全转换为图形对象。
使用这种自动生成方法,即无法单独列出图形对象,如何将图例添加到PDF的每个页面?