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R中plot3D包与数据标签的重叠

rgl r

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nilesguo · 技术社区 · 6 年前

我目前正在使用R中的plot3D包创建一个3D散点图,我想将数据标签添加到我的数据点。但是,我的一些数据点彼此具有相同的值,我想找到一个类似于ggrepel的解决方案,该解决方案可以将数据标签从点偏移,以便这些点的标签清晰可见。示例代码如下:

names <- c("A", "B", "C", "D", "E")
x <- c(1,1,2,3,4)
y <- c(1,1,3,4,5)
z <- c(1,1,4,5,6)

scatter3D(x, y, z)
text3D(x,y,z, names, add = TRUE, cex = 1)

A和B的标签目前相互重叠。

我也尝试使用directlabels包,但它似乎无法识别text3D或plot3D对象。任何帮助都将不胜感激。提前谢谢你!.

1 回复 | 直到 6 年前

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user2554330 6 年前

这个 plotrix::thigmophobe 函数计算方向,以尝试阻止二维绘图中的标签重叠。 rgl 没有任何等价物,而且由于可以旋转绘图,因此始终可以旋转彼此上方的标签。但是,下面的函数尝试为一个特定视图放置标签,以便它们不会重叠。

thigmophobe.text3d <- function(x, y = NULL, z = NULL, texts, ...) {
  xyz <- xyz.coords(x, y, z)

  # Get the coordinates as columns in a matrix in
  # homogeneous coordinates
  pts3d <- rbind(xyz$x, xyz$y, xyz$z, 1)

  # Apply the viewing transformations and convert 
  # back to Euclidean
  pts2d <- asEuclidean(t(par3d("projMatrix") %*% 
                         par3d("modelMatrix") %*% 
                         pts3d))

  # Find directions so that the projections don't overlap
  pos <- plotrix::thigmophobe(pts2d)

  # Set adjustments for the 4 possible directions
  adjs <- matrix(c(0.5, 1.2,   
                   1.2, 0.5,  
                   0.5, -0.2,  
                  -0.2, 0.5), 
                 4, 2, byrow = TRUE)

  # Plot labels one at a time in appropriate directions.
  for (i in seq_along(xyz$x)) 
    text3d(pts3d[1:3, i], texts = texts[i], 
           adj = adjs[pos[i],], ...)
}

上面的函数有一些问题:它基于 rgl::text3d 而不是 plot3D::text3D ,因此可选参数是不同的;它一次打印一个标签,如果有很多标签,它不执行错误检查等,则效率可能很低。

编辑以添加:

未发行版本0.99.20 rgl公司 添加 thigmophobe3d 函数来执行此操作。你得从 https://r-forge.r-project.org/R/?group_id=234 或Github镜像 https://github.com/rforge/rgl 现在。