R中的脚本到流程图

我通常用几个函数编写模块化脚本。当事情发展的时候,很难跟踪什么函数调用哪个函数(像这样命名它们 01-first.R 02-second.R 不总是可能的,我宁愿不把它作为最终的解决方案)。

这是一个潜在的例子 script.R

first <- function(...){
  # do data things
  return(first_output)
}

second <- function(first_output){
  # do data things
  # call helper
  x <- helper(...)
  # do things to x
  return(second_output)
}

third <- function(second_output){
  # do data things
  return(result)
}

我很想得到这样的东西

可以在R中使用 diagrammeR 包裹。

grViz("
digraph boxes_and_circles {

  # a 'graph' statement
  graph [overlap = true, fontsize = 10]

  # several 'node' statements
  node [shape = box,
        fontname = Helvetica]
  first; second; helper; third;

  # several 'edge' statements
  first->second second->helper 
  helper -> second
  second->third 
  third -> result
}
")

就这样(函数调用另一个函数)就太好了。真正令人敬畏的是一种根据参数显示分叉类型的方法(例如 first 有一个 go_to_third=FALSE 默认但如果 go_to_third=TRUE 它直接跳到 third ). 拥有函数所处理的对象类也很好。

我已经检查过这个问题 Visualizing R Function Dependencies 我想知道是否有更好的方法,视觉效果更好。

这个问题类似于MATLAB中的这个问题 Automatically generating a diagram of function calls in MATLAB