使用ruamel在yaml中插入节点

冲刺 - http://bio.tools/abyss 指示序列元素,如果以块样式转储Python列表,则会将其添加到输出中。

因此,不要这样做:

yaml_file_content['extra']['identifiers']['biotools'] = ['- http://bio.tools/abyss']

你应该做:

yaml_file_content['extra']['identifiers']['biotools'] = ['http://bio.tools/abyss']

然后使用以下命令强制以块样式输出所有组合元素:

yaml.default_flow_style = False

如果您想要更细粒度的控制,请创建 ruamel.yaml.comments.CommentedSeq 实例:

tmp = ruamel.yaml.comments.CommentedSeq(['http://bio.tools/abyss'])
tmp.fa.set_block_style()
yaml_file_content['extra']['identifiers']['biotools'] = tmp

加载YAML文件后,它不再是“YAML”;它现在是一个Python数据结构,并且 biotools 钥匙是一个 list :

>>> import ruamel.yaml as yaml
>>> data = yaml.load(open('data.yml'))
>>> data['extra']['identifiers']['biotools']
['http://bio.tools/abyss']

像任何其他Python列表一样,您可以 append 致:

>>> data['extra']['identifiers']['biotools'].append('http://bio.tools/anothertool')
>>> data['extra']['identifiers']['biotools']
['http://bio.tools/abyss', 'http://bio.tools/anothertool']

如果打印出数据结构,则会得到有效的YAML:

>>> print( yaml.dump(data))
extra:
  identifiers:
    biotools: [http://bio.tools/abyss, http://bio.tools/anothertool]

当然,如果出于某种原因你不喜欢列表表示法,你也可以得到语法上等价的:

>>> print( yaml.dump(data, default_flow_style=False))
extra:
  identifiers:
    biotools:
    - http://bio.tools/abyss
    - http://bio.tools/anothertool