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无法使用devtools安装r github包(curl超时错误)[closed]

devtools installation dns ubuntu r

stackinator Brenton Wiernik · 技术社区 · 5 年前

我目前无法使用devtools安装r github包。无论我尝试安装哪个Github包,都会出现相同的错误。这是一个例子。

devtools::install_github("clauswilke/ggtextures")

curl::curl_fetch_memory(url,handle=h)中出错:超时为到达:解析在10000毫秒后超时

这是R还是我的本地家庭WiFi的问题?本地家庭WiFi一直表现得很奇怪,尽管我可以发布它并观看YouTube视频。如果我输入一个新的网站地址,Chrome有时会在网站出现前5-10秒。从那一刻起,它就燃烧得很快。奇怪。

这听起来像是一个DNS问题?也许吧?还有别的吗?我从哪里开始?

[编辑] 我正在尝试下面显示的@hrbrmstr建议。那么,我应该改为opendns来解决这个问题吗?如果这是最好的解决方案,我会报告的。谢谢你的帮助,我认为它将教育更多的R的工具。我绝对赞成。

操作系统=Ubuntu 18.04

# docall(...)
                        host user.self sys.self elapsed user.child sys.child          result
2                 github.com     0.004    0.004  15.007          0         0  192.30.253.112
21         stackoverflow.com     0.003    0.000   5.005          0         0  151.101.193.69
3                 google.com     0.000    0.000   0.040          0         0   172.217.15.78
4                  yahoo.com     0.001    0.000   0.040          0         0     72.30.35.10
5  www.this-wont-resolve.com     0.003    0.001   0.267          0         0           Error
6                  cisco.com     0.001    0.000   0.041          0         0    72.163.4.185
7          bankofamerica.com     0.002    0.000   5.005          0         0 171.159.228.150
8                  apple.com     0.000    0.003   5.005          0         0   17.142.160.59
9              microsoft.com     0.001    0.001   5.003          0         0      40.76.4.15
10              curl.haxx.se     0.001    0.000   0.061          0         0  151.101.250.49

# pingr::ping(...)
ping: bad linger time.
                  [,1] [,2] [,3]
github.com          NA   NA   NA
stackoverflow.com   NA   NA   NA
google.com          NA   NA   NA
yahoo.com           NA   NA   NA
cisco.com           NA   NA   NA
time.apple.com      NA   NA   NA

# install.packages("speedtest")
Warning in install.packages :
  package âspeedtestâ is not available (for R version 3.5.1)

1 回复 | 直到 5 年前

hrbrmstr 5 年前

(这并不能解决你的问题,所以从技术上讲,这不是一个答案,但它也太长了,无法发表评论,所以学究们可以自由地投反对票)

虽然不是互联网连接技术支持论坛,但我们可以给你一些R工具来分类你的连接。

我知道有 curl 自尝试使用后安装的包 devtools 所以试试看:

do.call(
  rbind.data.frame,
  lapply(
    c(
      "github.com", "stackoverflow.com", "google.com", "yahoo.com",
      "www.this-wont-resolve.com", "cisco.com", "bankofamerica.com",
      "apple.com", "microsoft.com", "curl.haxx.se"
    ), 
    function(x) {
      clock <- system.time(res <- try(curl::nslookup(x), silent = TRUE), gcFirst = FALSE)
      clock <- as.list(clock)
      clock <- c(host = x, clock, result = if (inherits(res, "character")) res else "Error")
      clock
    }
  )
)

在我的系统上生成:

##                         host user.self sys.self elapsed user.child sys.child          result
## 2                 github.com     0.000    0.000   0.001          0         0  192.30.253.113
## 21         stackoverflow.com     0.001    0.000   0.001          0         0   151.101.65.69
## 3                 google.com     0.000    0.000   0.001          0         0  172.217.10.142
## 4                  yahoo.com     0.000    0.001   0.001          0         0      72.30.35.9
## 5  www.this-wont-resolve.com     0.071    0.002   0.073          0         0           Error
## 6                  cisco.com     0.000    0.000   0.001          0         0    72.163.4.185
## 7          bankofamerica.com     0.001    0.000   0.000          0         0 171.159.228.150
## 8                  apple.com     0.000    0.001   0.001          0         0   17.142.160.59
## 9              microsoft.com     0.001    0.000   0.001          0         0  40.113.200.201
## 10              curl.haxx.se     0.000    0.000   0.001          0         0  151.101.118.49

它所做的是使用操作系统的解析器库来进行DNS查找 卷曲 (因此) httr / rvest 以及 德沃茨 基于网络的安装程序)。您可以得到时间安排,还可以查看是否有错误。提供的列表中有一个故意的主机无法解析。请随意添加更多内容。

这应该让您了解一般来说是否存在解决问题的问题。

如果你有 pingr 已安装,可以执行以下操作:

t(sapply(
  c(
    "github.com", "stackoverflow.com", "google.com", 
    "yahoo.com", "cisco.com", "time.apple.com"
  ),
  function(x) {
    res <- try(pingr::ping(destination = x, count = 3, timeout = 5))
  }
))

在我的系统中,返回:

##                      [,1]   [,2]   [,3]
## github.com         30.095 23.964 31.652
## stackoverflow.com  16.524 13.529 20.790
## google.com         30.743 22.004 22.333
## yahoo.com          34.450 33.070 40.198
## cisco.com          67.215 74.290 96.568
## time.apple.com    110.832 88.482 87.582

这应该给你一个基本的概念,即基本的网络运营对互联网的影响有多大。超高值是不好的。

如果你有 speedtest 已安装,可以执行以下操作:

speedtest::spd_test()

从R控制台或:

Rscript -e 'speedtest::spd_test()'

从命令行/终端提示,它将为您提供如下输出:

## Gathering test configuration information...
## Gathering server list...
## Determining best server...
## Initiating test from Comcast Cable (###.###.###.###) to Otelco (Portland, ME)
## 
## Analyzing download speed..........
## Download: 166 Mbit/s
## 
## Analyzing upload speed......
## Upload: 7 Mbit/s

(是的,我们缅因州的农村地区有非常糟糕的互联网)

稍后我可以发布更多的故障排除信息。知道你使用的操作系统会很有帮助。

注意:您描述的一些行为表明有许多恶意软件在系统上劫持DNS(这也是我试图帮助的另一个原因)。