useDynLib()错误和compileAttributes不返回任何内容:将C库嵌入到R包中

我有一个C包,它构建了一个具有多个参数标志的可执行文件。其中一个使用Makefile编译代码(我知道,对于R包,这需要更改),并创建一个可执行文件以通过运行

$ ./codeName -f path/inputfile -o path/outputfile -p ## -s "type"

我的目标是将此C包中使用的几个函数集成到R库中。我看了一些关于 github.com/cran 在编写R扩展时,它解释了如何使用 .Call() 和 Makevars 为了从R调用C函数,我想避免类似瘟疫的情况。然而,这似乎需要用 SEXP 对象——所以我转向Rcpp(耶!)

我创建包 Rcpp.package.skeleton("packageName")

太棒了在R中,我执行以下操作:

$ R
> library(devtools)
> build()  # works!
> install() # works!
> library(packageName)
> rcpp_hello_world()
## expected output

一切正常。然后我将我的C包添加到 /src . 然后我执行 Rcpp::compileAttributes() 在通过R的包根目录中,什么都不发生,也没有输出,这是意料之中的,因为我还没有更改C代码。

我尝试使用上述命令安装: devtools::build() 和 devtools::install() . 通过 Makefile

** R
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded
Error in library.dynam(lib, package, package.lib) : 
  shared object ‘packageName.so’ not found
Error: loading failed
Execution halted'
ERROR: loading failed

嗯,这有点令人困惑,我不知道为什么会发生这种情况,但问题是 useDynLib("packageName") 在命名空间中。如果我删除它,C代码看起来是编译的,包通过 build/install 上面的命令。 rcpp_hello_world() 仍然有效。

(1) 为什么会出现这种错误 ‘packageName.so’ not found 现在就出现,我能绕过它吗?

(这个问题与Rcpp无关。)

.c 文件我添加

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

到a *.c 文件和 //[[Rcpp::export]] 在我想要导入的函数之前。(我不确定这是否会奏效 *.c ,或在C头文件中。)

接下来,我转到包根目录,打开R并尝试以下操作:

$ R
> library(Rcpp)
> compileAttributes()

运行时不会出错。但是,没有 RcppExports.R 和 RcppExports.cpp 已生成。编译C代码也会导致无法找到的错误 #include <Rcpp.h> .

(2) 为什么会这样 compileAttributes() Rcpp 和 //[[Rcpp::导出]] 为了将这些C函数包装成R可用的格式。