用C++编译C和C++代码时的链接错误

我注意到它在找 BWAGenome::BWTRestoreBWT 和 BWAGenome::GetMatches . 这些是它所寻找的成员函数,而不是根命名空间全局自由函数。

尝试将呼叫更改为 BWTRestoreBWT 这意味着要调用C函数 ::BWTRestoreBWT 在你的代码中,看看会发生什么。对呼叫执行相同操作 GetMatches .

告诉你C函数需要从静态C++函数调用的人是完全错误的。这将迫使你在C++静态函数中包装标准库,这只是愚蠢的。

尝试使用NM程序获取在程序中定义和引用的符号的输出:

nm file.o | grep BWTRestoreBWT

您应该看到您的符号有T或U。T表示名称已定义,后者表示符号未定义但已调用。为了连接,每个U都必须有对应的T。

确保您的函数没有内联限定符,除非它们在头文件中定义。

我越是考虑这个问题,类声明中声明的函数看起来就越像,但是函数没有相应的定义。

例如,此示例编译得很好,但产生的链接器错误与您看到的相同:

typedef unsigned int bwt_t;
typedef unsigned int bntseq_t;

class BWAGenome {
public:
    BWAGenome( char const* name);

    void BWTRestoreBWT( char const* name);

    void GetMatches( unsigned int, int, int, bwt_t*, bwt_t*, bwt_t*, bntseq_t*, bntseq_t*);
    void getMatches( unsigned int, int);

};

BWAGenome::BWAGenome( char const* name) 
{
    BWTRestoreBWT( name);
}

void BWAGenome::getMatches( unsigned int x, int y)
{
    GetMatches( x, y, 0,0,0,0,0,0);
}

int main()
{
    return 0;
}

是函数吗 BWTRestoreBWT() 和 GetMatches() 应该是 class BWAGenome 或者它们是被包装的C函数?如果是后者,那么这表示您将这些函数的头包含在错误的位置(实际上,它们确实需要 extern "C" 增加了连杆规格)。

根据问题中的新信息进行编辑:

在你编辑的问题中,你说:

//definition in BWAGenome.h
static bwt_t * BWTRestoreBWT(const char *fn);

//declaration in BWAGenome.cpp
static bwt_t * BWTRestoreBWT(const char *fn) {
    return bwt_restore_bwt(fn);
    //bwt_restore_bwt is a function in the C code that I am attempting to integrate
}

由于你原来问题中的错误,我只能假设 BWTrStReBubWT() 在里面 BWAGenome.h 在里面 半规管类 ,像这样:

class BWAGenome {
    // etc...

    static bwt_t * BWTRestoreBWT(const char *fn);

    // etc...
};

这意味着 BWTrStReBubWT() 是一个成员 class BWAGenome() 所以它的定义应该是(注意 BWAGenome:: 作用域运算符):

//declaration in BWAGenome.cpp
static bwt_t * BWAGenome::BWTRestoreBWT(const char *fn) {
    return bwt_restore_bwt(fn);
    //bwt_restore_bwt is a function in the C code that I am attempting to integrate
}

或者你可以移动的声明 BWTrStReBubWT() 在外面 半规管类 (更正式地称为“命名空间范围”)。

这样可以修复当前的链接器错误。如果您现在得到一个关于类似于 bwt_restore_bwt 找不到,你就会知道你需要做什么 外部“C” 对于C函数也是如此。

你告诉链接器在哪里可以找到包含 BWAGenome::BWTRestoreBWT 功能?由于您单独编译所有内容,所以必须显式链接输出.o文件。

可能导致此链接错误的两个原因是

1. 有一个对漂亮名字的定义,但你没有给链接器
2. 您给链接器的对象文件不包含方法,也就是说,您没有实现它(或者认为您实现了,但给了实现一个“错误”的名称)。

如果将静态关键字与非类成员函数一起使用,则该函数将具有本地链接,这意味着它在编译单元(即.cpp文件)之外将不可见。 您要么获取静态关键字,要么将函数体放入include文件中。

在类成员函数的上下文中,static有不同的含义。在这种情况下,static允许在不实例化类对象的情况下调用函数。

您是否检查过是否确实声明了形状相同的函数?

它在找 BWAGenome::BWTRestoreBWT(char const*) 但是也许你有 BWAGenome::BWTRestoreBWT(char *) (没有) const )改为声明?

错误发生在我将对象文件链接到一起的顺序上。我需要先链接C代码,然后再链接我创建的bhagenome类来调用它。链接器找不到C代码符号,因为它们尚未链接。不过,谢谢你的帮助。我想我让一些人失望了,但无论如何还是要谢谢你。