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Regex捕获组在regex101中工作,而不是sed

sed regex

abalter · 技术社区 · 2 年前

我找到了其他一些标题类似的问题,但没有找到答案。

我的文字是:

##bcftools_mergeCommand=merge --force-samples -m none -O v -o analysis/STUDY1/hg19/exome/merged.vcf --threads 4 analysis/STUDY1/hg19/exome/varscan_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/gatk_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/samtools_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/freebayes_norm.vcf.gz

我要你的名字。vcf。gz文件。

塞德告诉我:

echo "##bcftools_mergeCommand=merge --force-samples -m none -O v -o analysis/STUDY1/hg19/exome/merged.vcf --threads 4 analysis/STUDY1/hg19/exome/varscan_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/gatk_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/samtools_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/freebayes_norm.vcf.gz" | sed -En 's/\/([^\/]+\.vcf\.gz)/\1/g'

结果是空白的。

Regex101给出:

https://regex101.com/r/h3OGvN/1

1 回复 | 直到 2 年前

Cubix48 2 年前

为什么不使用grep呢?

$ data='##bcftools_mergeCommand=merge --force-samples -m none -O v -o analysis/STUDY1/hg19/exome/merged.vcf --threads 4 analysis/STUDY1/hg19/exome/varscan_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/gatk_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/samtools_norm.vcf.gz analysis/STUDY1/hg19/exome/freebayes_norm.vcf.gz'
$ echo $data | grep -Eo [^\/]+\.vcf\.gz
varscan_norm.vcf.gz
gatk_norm.vcf.gz
samtools_norm.vcf.gz
freebayes_norm.vcf.gz

-E :将模式解释为扩展正则表达式。
-o :仅打印匹配的(非空)零件。

tripleee 2 年前

Regex101支持的regex方言与 sed 理解。

具体地说,(去掉超级生物) g 标记并)添加一个 p 标记打印匹配行以修复此特定脚本;但在一般情况下,不要依赖一个不直接支持你真正想要使用的工具。

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