我刚刚开始使用python(anaconda3),我不知道下面的问题是什么
应该
真的很简单。。。我在互联网上到处寻找解决方案,但找不到。
目标:
我希望脚本将输入文本文件中的各个列(通过--column索引)写入各自的输出文本文件。用户可以选择任意数量的列(具有匹配数量的输出文件)。
示例:python septc。py—填充填充。txt—列0 2 3—输出文件out1。txt输出2。txt输出3。txt文件
我的问题:
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如何在各个输出文件中保存由--列向量定义的输入文件的各个列?
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用户给出的列的索引数可能会减少1,因为用户从1开始计算列,而python从0开始计算列,所以选择最后一个列是不允许的。。。虽然我可以在脚本的帮助文件中说,计数从0开始。
下面的脚本应该打印infle的第1、3和4t列,但它会将所有三列写入每个输出文件,而不是将第1列写入out1。txt,第三列输入out2。txt和out3的第4列。txt。这是bc,内部循环针对外部循环的每个实例执行。类似地,更改循环顺序会在每个输出文件中写入第4列,这不是我想要的。我尝试过其他方法(例如,对于np.nditer(col)中的c),但没有任何效果。
我怀疑这种for-loop方法在这里不合适。它应该类似于c列中的c将c写入关联的文本文件。。。但如何将列与其输出文件链接?!
我真的很感激你的帮助!
提前非常感谢您,
Nic
cols = [0,2,3]
data = np.arange(20).reshape(5,4)
np.savetxt('infile.txt', data, delimiter=' ', fmt='%1.0f')
f = np.loadtxt('infile.txt')
array([[ 0., 1., 2., 3.],
[ 4., 5., 6., 7.],
[ 8., 9., 10., 11.],
[ 12., 13., 14., 15.],
[ 16., 17., 18., 19.]])
######### Script (shorter version) #########
#!/usr/bin/env python
import numpy as np
import sys
import argparse
# Parse cmd line arguments
p = argparse.ArgumentParser()
p.add_argument('--infile', nargs='?', action="store", default=sys.stdin)
p.add_argument('--column', nargs='+', action="store", type=int)
p.add_argument('--outfile', nargs='+', action="store", default=sys.stdout)
nargs = p.parse_args()
# Assign cmd line arguments to variables
col = nargs.column
outfile = nargs.outfile
infile = nargs.infile
with open(infile) as infile:
data = np.loadtxt(infile)
# This is supposed to save each col into its respective output file ... supposed to ...
for out in outfile:
with open(out, 'wb') as f:
for c in col:
y = data[:,c]
np.savetxt(f, y, fmt='%1.0f')