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R用置信区间绘制图

ggplot2 r

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Varun · 技术社区 · 3 年前

我有一个这样的数据框-

df = data.frame(recall=c(0.55,0.62,0.43,0.61,0.19,0.14,0,0.19,0.33,0.33,0,0.33),
                type= c("Phone numbers","Phone numbers","Phone numbers","Phone numbers","Emails","Emails","Emails","Emails","URLs","URLs","URLs","URLs"),
                model=c("Cognition","TS-SAR","TS-ABINet","TS-RobustScanner",
                        "Cognition","TS-SAR","TS-ABINet","TS-RobustScanner",
                        "Cognition","TS-SAR","TS-ABINet","TS-RobustScanner"),
                lb=c(0.47,0.55,0.35,0.53,
                     0.07,0.04,0,0.07,
                     0.14,0.14,0,0.14),
                ub=c(0.63,0.7,0.51,0.69,
                     0.30,0.24,0,0.3,
                     0.52,0.52,0,0.52))

它由4个“图像中的文本检测”ML模型的结果组成。这个 recall 列具有每个模型的召回度量值,基于 type 检测到的文本数(电话号码、电子邮件或URL)。这个 ub 和 lb 列具有95%置信区间的召回下限值。

我想用R把它绘制成一个图。

ggplot2

pd <- position_dodge(width=0.2)

ggplot(df, aes(model,recall, color=type)) +
  geom_point(aes(shape=type),size=4, position=pd) +
  scale_color_manual(name="Type",values=c("coral","steelblue")) +
  scale_shape_manual(name="Type",values=c(17,19)) +
  theme_bw() +
  scale_x_continuous("Model", breaks=1:length(model), labels=model) +
  scale_y_continuous("Recall values") +
  geom_errorbar(aes(ymin=lb,ymax=ub),width=0.1,position=pd)

然而,这给了我一条错误消息

check\u breaks\u labels(breaks,labels)中出错:找不到对象“model”

你知道为什么这可能是个错误吗?此外,如果有人有任何建议,我也愿意接受绘制这些数据的新方法。谢谢

1 回复 | 直到 3 年前

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Allan Cameron 3 年前

您的代码需要进行一些调整。

首先, ggplot 仅在内部使用非标准评估 aes ,因此使用 model 在…内 scale_x_continuous 结果为“a” 模型 “未找到”错误。

其次,x轴 不是的 不断的它是离散的。如果不指定x轴比例,则打断/标签将是正确的。您只需删除该行并相信默认值即可。

第三 type

综上所述,我们有:

position <- position_dodge(width = 0.2)

ggplot(df, aes(model, recall, color = type)) +
  geom_point(aes(shape = type), size = 4, position = pd) +
  geom_errorbar(aes(ymin = lb, ymax = ub), width = 0.1, position = pd) +
  scale_color_manual("Type", values = c("coral", "steelblue", "green4")) +
  scale_shape_manual("Type", values = c(17, 19, 18)) +
  scale_y_continuous("Recall values") +
  theme_bw(base_size = 16)