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r pheatmap:在图例中使用对数缩放

pheatmap r

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Revan · 技术社区 · 6 年前

我有一个矩阵

library(pheatmap)
set.seed(1)
mat <- matrix(rexp(200, rate=.001), ncol=20)
pheatmap(mat)

有一个值比其他值高得多。因此,我想使用图例栏的对数比例(1,10,100,1000,…)。

有没有可能用 pheatmap 包裹?

编辑:我不想 log(mat) ,我只希望颜色缩放条按对数缩放(1、10、100、1000…)。

1 回复 | 直到 6 年前

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jay.sf 6 年前

只需加对数 legend_breaks 并显示最大的标签。

pheatmap::pheatmap(mat, legend_breaks=c(10^(0:ceiling(log10(max(mat)))), 
                                        round(max(mat), 2)))

顺从的