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流水线切割排序uniq

uniq cut pipeline sorting linux

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user1381852 · 技术社区 · 7 年前

cut -f 2 practice.sam > field2.txt | sort -o field2.txt sortedfield2.txt |  
uniq -c sortedfield2.txt

剪切正在努力从字段2中提取数字,然而,当试图将数字排序到新文件或同一文件中时,我只是得到一个空白。我试着把管道分成几个部分,但仍然会出现同样的错误。我打算使用这三个函数来实现输出计数。

2 回复 | 直到 7 年前

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user707650 user707650 7 年前

使用

cut -f 2 practice.sam | sort -o | uniq -c

在原始代码中,您重定向了 cut 到 field2.txt sort . 这行不通(除非你使用 tee ). 将命令作为单个命令分开(例如,使用 ;

同上,在下半部分中,您将输出写入 sortedfield2.txt stdout ,并且没有任何东西被输送到 uniq

因此,另一种选择可能是:

cut -f 2 practice.sam > field2.txt ; sort -o field2.txt sortedfield2.txt ; uniq -c sortedfield2.txt

cut -f 2 practice.sam > field2.txt 
sort -o field2.txt sortedfield2.txt 
uniq -c sortedfield2.txt

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bozkurt.ykp 7 年前

您可以使用以下命令:

cut -f 2 practise.sam | uniq | sort > sorted.txt

在你的代码中是错误的。错误是“没有这样的文件或目录”。因为管道。你可以通过这个链接了解它的使用方法