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R: 如何从coxme包中的lmekin中提取R平方

random-effects mixed-models r

b82mo · 技术社区 · 7 年前

我试图找出我的带有家庭效应的混合模型与数据的吻合程度。可以从lmekin函数中提取r平方值吗?如果是这样,是否有可能提取每个协变量的部分r平方值? 例子:

model= lmekin(formula = height ~ score + sex + age + (1 | IID), data = phenotype_df, varlist = kinship_matrix)

我试过MuMin软件包,但它似乎不适用于lmekin模型。谢谢

1 回复 | 直到 7 年前

Lucy 7 年前

我可以使用 r.squaredLR() 作用

library(coxme)
library(MuMIn)
data(ergoStool, package="nlme")  # use a data set from nlme 
fit1 <- lmekin(effort ~ Type + (1|Subject), data=ergoStool)
r.squaredLR(fit1)

phenotype_df 看起来,我无法按原样运行您的代码,这方面的一个很好的资源是 reprex 包装)。

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